Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHDQ96IW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHDQ96IW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHDQ96IW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms