Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms