Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNF8Q96H20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNF8Q96H20 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms