Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RNF185Q96GF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF185Q96GF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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