Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP6Q96FZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms