Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STAMBPL1Q96FJ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms