Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDL1Q96EA4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms