Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTERF3Q96E29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTERF3Q96E29 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms