Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM44Q96DX7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms