Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ROPN1LQ96C74 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROPN1LQ96C74 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1LQ96C74 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms