Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ULK4Q96C45 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms