Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYTL4Q96C24 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYTL4Q96C24 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SYTL4Q96C24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms