Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN23Q96B33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN23Q96B33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN23Q96B33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms