Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLNQ969V3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms