Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM63Q969Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TRIM63Q969Q1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TRIM63Q969Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM63Q969Q1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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TRIM63Q969Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TRIM63Q969Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TRIM63Q969Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRIM63Q969Q1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRIM63Q969Q1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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