Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1MTQ969P6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms