Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2FQ969M7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2FQ969M7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2FQ969M7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms