Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFKQ969G6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFKQ969G6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFKQ969G6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFKQ969G6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFKQ969G6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms