Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD2Q969F2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD2Q969F2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms