Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAMP4Q969E2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP4Q969E2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms