Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRN2Q92932 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRN2Q92932 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms