Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM3CQ92520 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms