Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG3Q8WXD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 468.9 ms