Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE2Q8WWL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE2Q8WWL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE2Q8WWL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms