Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTRT1Q8TDG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms