Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA3Q8TBC4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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