Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD1Q8NHV4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD1Q8NHV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD1Q8NHV4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms