Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL2Q8NHH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL2Q8NHH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL2Q8NHH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.2 ms