Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTLL11Q8NHH1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTLL11Q8NHH1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTLL11Q8NHH1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms