Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC148Q8NFR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC148Q8NFR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms