Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF397Q8NF99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF397Q8NF99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms