Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHDC9Q8NEP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC9Q8NEP7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms