Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3C3Q8NEB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3C3Q8NEB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms