Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13CQ8NE31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13CQ8NE31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13CQ8NE31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms