Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF248Q8NDW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF248Q8NDW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF248Q8NDW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms