Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AVL9Q8NBF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms