Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11CQ8NB49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11CQ8NB49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms