Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSIP1Q8NA03 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSIP1Q8NA03 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms