Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJD3Q8N144 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD3Q8N144 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms