Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV63

VRK3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK3Q8IV63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK3Q8IV63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK3Q8IV63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VRK3Q8IV63 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms