Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLF3Q8IUI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLF3Q8IUI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms