Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms