Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms