Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RD3Q7Z3Z2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RD3Q7Z3Z2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms