Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA2D4Q7Z3S7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA2D4Q7Z3S7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms