Protein–RNA interactions for Protein: Q7L985

LINGO2, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO2Q7L985 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINGO2Q7L985 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LINGO2Q7L985 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINGO2Q7L985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms