Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYFIP1Q7L576 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYFIP1Q7L576 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYFIP1Q7L576 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199 ms