Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HECW1Q76N89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HECW1Q76N89 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
HECW1Q76N89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
HECW1Q76N89 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms