Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM136Q6ZRR5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM136Q6ZRR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms