Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC73Q6ZRK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms